V České republice bylo dosud identifikováno přes 470 druhů nepůvodních patogenů rostlin a živočichů. Následující přehled se věnuje druhům invazním – tj. těm, které mají potenciál se po zavlečení nekontrolovaně šířit v přírodním prostředí a představovat rizika pro biologickou rozmanitost a ekosystémové služby (takových je zhruba jedna desetina ze zjištěného počtu). Přehled zahrnuje všechny významné a již delší dobu naturalizované druhy (např. Ophiostoma novo-ulmi), zástupce nově invadujících či již naturalizovaných, ale méně známých, avšak rovněž nebezpečných druhů (např. Cryptostroma corticale) a některé druhy méně známé s relativně slabším impaktem, které však zasahují biotopy dosud považované za prosté invazí (např. Colletotrichum salicis). Výběr detailně prezentovaných druhů rozhodně není kompletní, jeho cílem je spíše přiblížit zástupce nejrůznějších ekologických skupin patogenů pronikajících do nejrůznějších biotopů a společenstev a demonstrovat tak šíři a rozsah problému invazí těchto organismů.